| 1. | 2021-Atual. Feebacks Planta-Solo na Floresta Amazônica e em Sistemas Agrícolas no Estado do Amazonas Descrição: Os processos físicos, químicos e biológicos mantem interação constante entre planta e solo. Os efeitos desses processos são denominados feedbacks planta-solo e são pouco conhecidos nos solos da Amazônia, sendo críticos para se restaurar a biodiversidade vegetal e as propriedades dos ecossistemas. O objetivo deste projeto é avaliar os feedbacks planta-solo na floresta e em sistemas agrícolas no Amazonas. Pretende-se consolidar os conhecimentos sobre a diversidade microbiana dos solos amazônicos assim como de suas características químicas, físicas e biológicas e a identificação de organismos-chave para o repovoamento microbiano em ações de recuperação de áreas degradadas no Amazonas, em curso desde 1977 pelas equipes do INPA/EMBRAPA. Além disso, ocorrerá fortalecimento da cooperação entre os grupos de pesquisa do INPA-EMBRAPA e CENA/ESALQ (USP), através do desenvolvimento de estratégia de enriquecimento microbiológico de solos degradados empobrecidos, facilitando estabelecimento da nova vegetação. As informações tanto de áreas de florestas da Amazônia como da Mata Atlântica suportam nossas hipóteses quanto à regeneração pela flora (e fauna) de diferentes áreas de estudos de ambos grupos. E, da mesma forma, o projeto deverá estabelecer as metodologias usadas pelo projeto FAPESP-NWO (Mata Atlântica), em desenvolvimento pelo Programa FAPESP-Biota, em colaboração com as equipes do projeto ?Seringueira tricomposta como principal componente em plantios sucessivos na Amazônia? (SEG Embrapa) financiado pela FAPEAM e da equipe do INPA, no programa de restauração de áreas degradadas via sistemas agroflorestais e agrícolas sustentáveis.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Doutorado: (4) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Integrante / Siu Mui Tsai - Coordenador / Luiz Antônio de Oliveira - Integrante / Aleksander Westphal Muniz - Integrante / Rogério Eiji Hanada - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1A. |
| 1. | 2018-Atual. Applying the ?biotic soil legacy? approach to understand positive-negative biota interactions for direct forest restoration from plant-soil communities feedbacks ? ?BioFor? Descrição: As plantas e os solos estão em constante interação, e os efeitos observados para todos os processos físicos, químicos e biológicos que contribuem para essas interações resultam em um chamado "planta-solo feedback " que é conhecido por ser crítico para a restauração das comunidades originais de plantas e das propriedades do ecossistema. O uso anterior da terra em locais onde a Mata Atlântica deve ser restaurada alterou a contingência histórica das propriedades do solo, o que influenciará na restauração florestal por efeitos dessa herança. A existência de realimentação planta-solo tem sido demonstrada em florestas que variam de sistemas tropicais a temperados, no entanto, pouco, ou nada é conhecido sobre o feedback planta-solo na Mata Atlântica. Nosso objetivo é investigar como as reações entre plantas e solo operam na Mata Atlântica primária e secundária (em regeneração), e como as reações em áreas atualmente desmatadas podem influenciar as oportunidades de restauração bem-sucedida da diversidade original de espécies arbóreas e do funcionamento do ecossistema florestal. Primeiro, deveremos coletar um conjunto de dados observacionais em grande escala sobre a riqueza de espécies do solo e a abundância de microorganismos (bactérias, fungos, protistas) e pequenos invertebrados (nematóides), para caracterizar as redes de solo. Esses dados serão vinculados a informações sobre composição vegetal / árvores e propriedades abióticas do solo em florestas naturais (originais) e restauradas, bem como áreas desmatadas a serem utilizadas para restauração florestal. Em seguida, examinaremos empiricamente os feedbacks de solo-planta desses solos, a fim de determinar sua adequação para a regeneração florestal. Para este propósito, os gráficos de campo que podem gerar informações espacialmente explícitas sobre um intervalo de variáveis ao longo do tempo serão estabelecidos ao longo de 100 transectos ao longo das diferentes paisagens. Combinando modelos de ecossistemas e dados de rede de parcelas de campo, iremos avaliar quais condições de solo fornecem as melhores possibilidades para a restauração florestal. Ao gerar informações espaciais e temporais sobre uma série de variáveis ao longo do tempo e escala, incluindo interações positivas e negativas das comunidades acima e abaixo do solo, determinaremos se esses efeitos são mais pronunciados em solos sob vegetação original ou restaurada do que em solos degradados, ou se são sistemas restaurados sem sucesso. Dados sobre áreas perturbadas com oportunidades menos ou mais adequadas para possibilitar interações planta-solo para espécies de plantas florestais / espécies de árvores nos permitirão obter informações para um plano adequado para melhorar e acelerar os programas de restauração da Mata Atlântica.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (3) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Integrante / Siu Mui Tsai - Coordenador / Ricardo Ribeiro Rodrigues - Integrante / Wim van der Putten - Integrante / Acácio Aparecido Navarrete - Integrante / Lucas William Mendes - Integrante / Pedro H. Brancalion - Integrante / Wanderley Bieluczyk - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa. Membro: Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1A. |
| 1. | 2016-2021. EMU concedido no processo 2015/22617-5: Dual-laser Trace Gas Monitor Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1A. |
| 2. | 2016-2016. INCT-Microbiomas Descrição: INCT 2014. Situação: Desativado; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Tsai Siu Mui - Integrante / Siu Mui Tsai - Coordenador / Daniel Saito - Integrante / Luiz Fernando Wurdig Roesch - Integrante. Membro: Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1A. |
| 3. | 2016-2018. Proposta de melhorias na infraestrutura de pesquisa do CENA: rede sem fio (wireless) e internet, central analítica multiusuário e destinação de resíduos químicos Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Tsai Siu Mui - Integrante / Siu Mui Tsai - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1A. |
| 4. | 2016-2018. Reserva Técnica FAPESP para Apoio Institucional à Pesquisa Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Tsai Siu Mui - Integrante / Siu Mui Tsai - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1A. |
| 1. | 2014-2021. Dimensoes US-FAPESP Biota-SP: Pesquisa Colaborativa Integrando as dimensoes da Biodiversidade Microbiana ao Longo de Areas sob Alteracao do Uso da Terra em Florestas Tropicais (FAPESP-BIOTA-NSF DIMENSIONS) Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Doutorado: (8) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Integrante / Siu Mui Tsai - Coordenador / Jorge Mazza Rodrigues - Integrante / Brendan J. Bohannan - Integrante / Fernando Dini Andreote - Integrante / Paulo Artaxo - Integrante / Plinio Camargo - Integrante / Scott Saleska - Integrante / Carlos Martinez - Integrante. Financiador(es): National Science Foundation - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1A. |
| 2. | 2014-2021. Integrando as dimensões da biodiversidade microbiana ao longo de áreas de alteração do uso da terra em florestas tropicais (FAPESP-BIOTA-NSF DIMENSIONS) Descrição: Microrganismos coordenam os processos ecológicos dos quais a vida depende, sendo que nós sabemos menos sobre sua biodiversidade, do que para plantas e animais. A Ecologia Microbiana é muita sofisticada na estimativa das dimensões filogenética, genética e funcional da biodiversidade microbiana, porém, a integração dessas dimensões é alusiva. Este projeto irá combinar recentes avanços sequenciamento de ácidos nucleicos e biogeoquímica de ecossistemas para acessar uma questão marcante da biogeoquímica moderna; o que controla o ciclo do metano ao longo de gradientes de uso do solo em florestas tropicais? A resposta a essa questão requer que nós acessemos o desafio fundamental da biologia de entender as interações e feedbacks entre as três dimensões da biodiversidade. Para responder essas questões, serão acessadas as dimensões genética, filogenética e funcional da biodiversidade de bactérias e arqueias em duas florestas tropicais brasileiras ameaçadas pelo desenvolvimento: uma floresta tropical da Amazônica Oriental, em Rondônia e uma Reserva da Amazônia Ocidental perto de Santarém. Essas florestas abrigam uma gama de tipos de ecossistemas, características de solo e histórico de uso do solo. Serão acessadas três dimensões da biodiversidade microbiana do solo: (1) composição da comunidade microbiana e diversidade filogenética através de sequenciamento em larga escala de genes do ciclo do metano (pmoA e mcrA); (2) sequenciamento completo da diversidade genética (com foco no potencial metabólico) através de regiões de genes alvo e sequenciamento metagenômico de fragmentos de genoma relevantes funcionalmente; e (3) diversidade funcional do ecossistema como um todo, através de observações de emissão/consumo de metano e seus isótopos, que serão então comparados as proporções de transcritos: genes para os genes do ciclo do metano. Para integrar de maneira profunda todas as três dimensões da biodiversidade microbiana, será usada uma abordagem em dois níveis: (1) Integração estatística pareada entre os dados das dimensões adjacentes; (2) integração simultânea de todas as três dimensões através do desenvolvimento de um modelo computacional baseado em características (Micro Trait-ME), que combina identidades taxonômicas, abundâncias e valores de características (inferidas do conteúdo genético e dos dados de expressão) para predizer a resposta do ciclo do metano à mudança de uso do solo. Esse modelo será útil para uma ampla comunidade de pesquisadores.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (4) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Integrante / Siu Mui Tsai - Coordenador / Cosme Damiao Cruz - Integrante / Marcelo Moreira - Integrante / NUSSLEIN, K. - Integrante / Fernando Dini Andreote - Integrante / Plinio Camargo - Integrante / Scott Saleska - Integrante / RODRIGUES, JORGE L. M. - Integrante / Clovis Daniel Borges - Integrante / Brendan Bohannan - Integrante / Andressa Monteiro Venturini - Integrante / Vanderlei Bieluczyk - Integrante / Beatriz Maria Ferrari Borges - Integrante / Fabiana Paula - Integrante / Victor Pylro - Integrante / Andreas Braendholt - Integrante / Laura Meredith - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / National Science Foundation - Cooperação / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Membro: Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1A. |
| 1. | 2012-2014. Bioindicadores funcionais para monitoramento da qualidade do solo para o manejo sustentável da produção de biomassa em cana-de-açúcar (BIOSQ) Descrição: Estudos prévios e atuais do parceiro BE-Basic definiram recentemente o termo Normal Operating Range (NOR) para avaliação da estrutura das comunidades microbianas e seu potencial functional em solos holandeses (Projetos EcoGenomics e EcoLinc), baseados em tecnologias de microarranjos e PCR-quantitativo, utilizando um sistema integrado de análises de solos, perfis de comunidades microbianas, qPCR, sequenciamento em larga escala (pirosequenciamento), microarranjos filogenéticos (PhyloChips) e funcionais (GeoChips). De forma especial, esses estudos sugerem que distintos grupos microbianos podem servir como indicadores de específicas condições de solo, por ex., pH ou estado nutricional, sugerindo fortemente que existem bio-indicadores microbianos em solo e que podem ser explorados para fornecer informação rápida sobre o estado do solo. Este projeto visa também determinar as categorias de genes em funções chaves (nitrificação, fixação de nitrogênio, desnitrificação) mais indicativos do estado específico do solo; determinar bio-indicadores funcionais nos processos de emissão/seqüestro dos gases de efeito estufa (C02, CH4, N20); desenvolver uma plataforma para levantamento e monitoramento de bio-indicadores taxonômicos e funcionais que serão obtidos neste projeto para o manejo sustentável da produção cana-de-açúcar; aplicação de ferramentas de bioinformática e análise estatística multivariada para integrar os dados e atributos físico-químicos do solo com o objetivo de monitorar os microrganismos e os genes funcionais associados aos ciclos biológicos do C e N no solo; testar e validar a plataforma Be-Basic ("BIOSQ") em estações experimentais com cultivos de cana-de-açúcar da APTA no Estado de São Paulo. A meta é a identificação de numerosos grupos taxonômicos e genes com potencial para uso como bio-indicadores de atributos específicos do estado do solo, tais como disponibilidade de nutrientes, nível de perturbação e fertilidade do solo, e permitir a aplicação de uma plataforma para determinação da qualidade do solo baseada nesses bio-indicadores. Esta forma padronizada de análise requererá um menor esforço de conhecimento especializado. Nosso projeto trará contribuições importantes para o Programa FAPESP-BIOEN, que tem a meta de estudar os impactos de uma economia baseada em sistemas biológicos alternativos no ambiente e na saúde humana.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (5) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Integrante / Siu Mui Tsai - Coordenador / Acácio Aparecido Navarrete - Integrante / Eiko Eurya Kuramae - Integrante / Clovis Daniel Borges - Integrante / MELLIS, ESTÊVÃO V. - Integrante / Eliana G.G. Lemos - Integrante / Borges, Beatriz Maria Ferrari - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1A. |
| 1. | 2011-2013. The microbiome of Amazonian Dark Earth: Structure and function of the microbial communities from rhizosphere and biochar associated to the biogeochemical processes (BIOTA/FAPESP: MICROORGANISMOS) Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (5) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador / Eikio Eurya Kuramae - Integrante / Aleksander Westphal Muniz - Integrante / Newton Paulo Falcão - Integrante / Carles R. Clement - Integrante / Eduardo Goes Neves - Integrante / Joao Lucio de Azevedo - Integrante / Fabiana de Souza Cannavan - Integrante / Mariana Germano Silva - Integrante / Rodrigo Gouvea Taketani - Integrante / Amanda Barbosa Lima - Integrante / Janne Louize Souza Santos - Integrante / Beata Emoke Madari - Integrante. Membro: Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1A. |
| 1. | 2010-2012. Aquisição de sistema com plataforma para microdissecção por captura a laser aplicada em estudos de biologia celular e molecular Descrição: Sistema de plataforma, para tecnologia de microdissecção por gravidade e movimentação de feixe de laser sobre amostras, para possibilitar estudos por dissecção e captura de células de um tecido ou rizosfera, e ao mesmo tempo, garantindo alto desempenho em termos de velocidade e precisão da microdissecção de amostras com diferentes espessuras. Esta tecnologia tem sido aplicada para obter células de plantas e mais recentemente para estudar as interações planta-microrganismo. Particularmente, as técnicas usadas em estudos nas interações planta-microrganismos, são de grande relevância para as pesquisas planta-patógeno e planta-microrganismos mutualísticos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador / Maria Helena de Souza Goldman - Integrante / Adriana P M Rodrigues - Integrante / Marcelo Carnier Dornelas - Integrante / Adriana Pinheiro Martinelli - Integrante / Sergio Line - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1A. |
| 1. | 2009-2011. Avaliação de sistemas de uso do solo por meio de indicadores de sustentabilidade ambiental microbiológico e bioquímico em sistemas florestais e agroflorestais Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Tsai Siu Mui - Integrante / Maria de Lourdes de Oliveira - Integrante / Maria de Lourdes Pinheiro Ruivo - Coordenador / Dirse Kern - Integrante. Financiador(es): Fundação Amazônia Paraense de Amparo à Pesquisa - Auxílio financeiro. Membro: Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1A. |
| 2. | 2009-2011. Identificação de genes do feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris) envolvidos na resistência a estresses bióticos (antracnose) e abióticos (seca) Descrição: O presente projeto pretende identificar genes que controlam os mecanismos de defesa e adaptação do feijoeiro à falta de água e ao ataque de patógenos durante o seu desenvolvimento, e identificar e analisar genes análogos de resistência (RGAs) em bancos de dados de sequências expressas (ESTs) de feijoeiro. Para isto, duas bibliotecas subtrativas de cDNA serão construídas para identificar genes diferencialmente expressos em variedades de P. vulgaris contrastantes quanto à tolerância ao estresse hídrico (5000 sequências por biblioteca); duas bibliotecas para identificar genes diferencialmente expressos em plantas inoculadas com C. lindemuthianum e induzidas ou não com silício (5000 sequências por biblioteca); e serão gerados marcadores moleculares TRAP para resistência a antracnose a partir de sequências buscadas no banco de dados do feijão comum. Os resultados obtidos fornecerão bases moleculares para o entendimento do controle genético da resistência do feijoeiro comum a estresses bióticos e abióticos de grande importância para a cultura, e poderão levar à indicação de genes candidatos para uso como marcadores moleculares e na transformação genética, auxiliando os programas de melhoramento genético. A interação entre os laboratórios de Biologia Celular e Molecular do CENA/USP, do Laboratório de Genética Fisiológica (ESALQ/USP) e do Laboratório de Genética de Leguminosas (IAC/APTA) proporcionará o intercâmbio entre as pesquisas com as variedades propostas neste projeto, muitas delas com grande potencial para comercialização, uma vez que provém de programa melhoramento genético de feijoeiro realizado pelo IAC/APTA, Campinas - SP.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (2) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador / Luís Eduardo Aranha Camargo - Integrante / Carlos Alberto Labate - Integrante / Adriana P M Rodrigues - Integrante / Marcelo Carnier Dornelas - Integrante / Sérgio Augusto Moraes Carbonell - Integrante / Danielle G.G. Caldas - Integrante / João Bosco dos Santos - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Membro: Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1A. |
| 3. | 2009-2013. Monitoring the microbial diversity and functional activities in response to land-use changes and deforestation under soybean and sugarcane cultivations Descrição: A presente proposta deverá desenvolver ferramentas bioquímicas e moleculares para avaliar os impactos que as emissões dos gases de efeito estufa/sequestro de C devido ao uso da terra para cultivos de soja e cana-de-açúcar em três áreas localizadas em regiões de grande expansão agrícola dessas culturas, que incluem Mato Grosso (MT e MS) e São Paulo. Nossa proposta é integrar pesquisas de diferentes áreas da agronomia, química do solo e microbiologia, biologia molecular, bioinformática e geoprocessamento, em um esforço para detectar, quantificar e correlacionar os processos microbiológicos envolvidos nos processos de transformação envolvidos nos ciclos biogeoquímicos do C e N em solos sob cultivo de soja e cana-de-açúcar, tanto em áreas sob cultivo convencional como sob manejo conservacionista (plantio direto e uso de palhada), sempre em comparação com solos naturais, sem cultivo agrícola (floresta). Esta proposta recebeu apoio da FAPESP, dentro do Programa de Pesquisas sobre Mudanças Climáticas Globais (PFPMCG) para seu desenvolvimento ao longo dos próximos quatro anos (FAPESP 08/58114-3) e conta com apoio de pesquisadores do CENA/USP, FCAV/UNESP, FOP/UNICAMP (Site: http://www.fapesp.br/materia/5189). Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (3) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador / Eliana Gertrudes Macedo Lemos - Integrante / Daniel Saito - Integrante / Lúcia Maria Carareto Alves - Integrante / Carlos Clemente Cerri - Integrante / Brigitte Josefine Feigl - Integrante / Danielle G.G. Caldas - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa. Membro: Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1A. |
| 4. | 2009-2012. Tecnologia para produção em larga escala por cultivo in vitro de bambu gigante (Dendrocalamus giganteus Munro) e de carvão pirogênico a partir de seus subprodutos para a agricultura sustentável Descrição: Dendrocalamus giganteus Munro é uma planta perene que pertence à sub-família Bambusoideae da família Poacea, das gramíneas. É considerada a maior espécie de bambu, contribuindo para a produção de grande quantidade de biomassa vegetal que pode ser processada para desenvolver novos produtos para substituir a madeira. A sua micropropagação tem sido recomendada, uma vez que seus propágulos são mais limitados e sementes são raras devido ao seu longo ciclo de florescimento de 76 anos. Dessa forma, tomando em consideração as dificuldades da propagação convencional de bambu, a micropropagação in vitro de gemas axilares se constitue como uma boa alternativa para a multiplicação em larga escala de bambu gigante (Dendrocalamus giganteus Munro). Durante o processo de produção convencional de carvão, aproximadamente 35% do carbono é fixado na forma de carvão, 35% do carbono compõem os chamados gases condensáveis (extrato pirolenhoso), 5% sob forma de alcatrão, sendo o restante lançado à atmosfera na forma de gases não condensáveis (CO2, CO, CH4 etc). Existe hoje tecnologia adequada para recuperação de até 50% do carbono perdido na forma de gases condensáveis, sendo o produto condensado explorado comercialmente por pequenas empresas (Benites et al. 2005), além de ser uma excelente forma de seqüestro de carbono para a atmosfera, contribuindo para diminuir a emissão de gases de efeito estufa. O objetivo principal desta proposta é de estabelecer um sistema de produção em larga escala de bambu gigante (Dendrocalamus giganteus Munro) para seu uso como fonte de biomassa e de madeira para a indústria e utilizar os subprodutos para produção de carvão pirogênico parcialmente carbonizados para recuperação de solos degradados, tanto como condicionador do solo e seqüestro de carbono sob forma reativa, como veículo de nutrientes e de microrganismos que atuam como promotores de crescimento vegetal. Para tanto, propõe-se o cultivo in vitro de D. giganteus por meio de micropropagação in vitro, a. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador / Adriana P M Rodrigues - Integrante / Newton Paulo da Silva Falcão - Integrante / Danielle G.G. Caldas - Integrante / José Otávio Brito - Integrante / Etelvino Henrique Novotny - Integrante / Monica Lanzoni Rossi - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Membro: Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1A. |
| 1. | 2008-2012. Construção de bibliotecas subtrativas de cDNA para identificar genes diferencialmente expressos em cultivares de feijão (Phaseolus vulgaris L.) tolerantes e suscetíveis ao estresse hídrico Descrição: Programa Nacional de Pós-Doutorado. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador / Danielle G.G. Caldas - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa. Membro: Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1A. |
| 2. | 2008-2011. Detecção de Archaea metanogênicas, seu papel funcional e sua contribuição na estrutura das comunidades microbianas na Terra Preta Antropogênica e adjacência Descrição: Métodos moleculares podem ser aplicados em estudos de diversidade microbiana da Terra Preta Antropogênica da Amazônia, possibilitando a identificação independente de cultivo de número abrangente de espécies bacterianas, incluindo aquelas fastidiosas ou não passíveis de cultivo, as quais dificilmente seriam identificadas pelos métodos convencionais. Para um estudo mais completo, propõe-se também associar métodos convencionais de isolamento para confirmação de espécies conhecidas e identificação de novas espécies. A análise das comunidades microbianas por T-RFLP (Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism) e DGGE (Denaturing Gradient Gel Electrophoresis) pode indicar a diversidade microbiana dos solos e determinar . É um método muito sensível a mudanças na estrutura microbiana do solo, além de possuir alta capacidade de processamento disponível, permite analisar comparativamente muitas amostras sob o foco da funcionalidade sob diferentes sistemas de uso da terra, usando TPA como solo modelo. Em casa-de-vegetação, o bolsista (Nível I) deverá participar dos estudos com TPA em microcosmos para avaliar o papel das Archaea metanogênicas e das amonificantes após a introdução de uma leguminosa ou de uma gramínea. O estudo da rizosfera das plantas deverá indicar qual das plantas hospedeiras contribui melhor para a transformação do nitrogênio orgânico e correlacionar com grupos funcionais de ciclagem de nitrogênio. O cultivo e detecção de Archaea metanogênicas pelo outro bolsista (Nível II) no estudo do metano poderá indicar a ação dos microrganismos Archaea no ambiente rizosférico, que deverá ser correlacionado com a presença dos metanogênicos. A detecção de Archaea metanogênicas do solo será realizada pela técnica de PCR, usando o gene mcrA como marcador molecular, além de permitir a sua detecção quantitativa nos sítios da rizosfera e nos solos adjacentes.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Especialização: (1) Doutorado: (1) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador / Rodrigo Gouvêa Taketani - Integrante / Wenceslau G. Teixeira - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1A. |
| 1. | 2006-2008. Atividade metabólica, diversidade bacteriana da Terra Preta de Índio da Amazônia Central e determinação de compostos naturais produzidos por actinobactérias Descrição: A elaboração de uma prospecção da caracterização bioquímica e da diversidade microbiana dos solos TPI é de suma importância para o conhecimento da extensão da diversidade deste bioma tropical e para a sustentabilidade da agricultura. Este projeto propõe efetuar análise da diversidade microbiana de solos TPIs através de atividades bioquímicas associadas com a presença dos microrganismos, determinar a estrutura dessas comunidades através da técnica de t-RFLP (Terminal Restriction Length Polymorphism) e desenvolver estudos com actinobactérias isoladas da Amazônia para identificação de peptídeos de origem não-ribossomal, que podem ser detectados intra ou extracelularmente em condições in vitro ou in vivo. As actinobactérias são consideradas as maiores produtoras de metabólitos secundários bioativos, tais como os antibióticos ou citostáticos. Devido à resistência a muito dos antibióticos pelas bactérias patogênicas, torna-se necessária a busca por novos produtos naturais, os quais são requeridos para o desenvolvimento de novos compostos farmacêuticos. Quimioensaios serão realizados para a busca de possíveis novos peptídeos. A extração e purificação serão realizadas por cromatografia líquida. Os peptídeos serão investigados quanto a sua capacidade quelante. Entre as enzimas envolvidas na biossíntese de metabólitos secundários encontram-se as sintases de policetônicos (PKSs) e as sintetases de peptídeos não-ribossômicos (NRPSs), cujas seqüências gênicas são conhecidas. A identificação das espécies que apresentam essas enzimas permitirá futuramente isolar o composto produzido e permitirá sua caracterização estrutural.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador / Brendan O´Neill - Integrante / Wenceslau G. Teixeira - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Membro: Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1A. |
| 2. | 2006-2009. Bioprospecção de genes associados à catálise e degradação enzimática de hidrocarbonetos policíclicos aromáticos por bactérias e por análise metagenômica em Terra Preta de Índio da Amazônia Descrição: A caracterização de genes envolvidos na síntese de enzimas degradadoras de poluentes e xenobióticos, juntamente com estudos sobre a diversidade genética destas estirpes, poderão disponibilizar informações importantes sobre o comportamento destes microrganismos em condições ambientais extremas, bem como prover informação sobre a síntese de genes envolvidos em vias degradadoras para estudos de bioprospecção gênica, visando a busca por novas atividades catalíticas para fins químicos e biotecnológicos, refletindo o ilimitado poder da bioquímica microbiana em solos tropicais. Propõe-se em uma primeira etapa, a avaliação de isolados (em torno de 100) de Pseudomonas e Burkholderia provenientes de solos TPI e adjacência quanto à presença do gene nahAc e, através de bioensaios usando estirpes referências, determinar o seu potencial de degradação in vitro. Em paralelo, estudos sobre a biodiversidade genética desses isolados serão desenvolvidos através da técnica de Automated Ribossomal Intergenic Spacer Analysis (ARISA) para determinação das relações filogenéticas entre esses isolados e para estudos bioquímicos posteriores. Em uma segunda etapa, será prospectado o operon nahAc na já construída biblioteca metagenômica de solo TPI, sob coordenação do Prof. Spartaco Astolfi-Filho, da Universidade Federal do Amazonas (UFAM-Manaus, AM) e em colaboração com o CENA-USP, Piracicaba (SP), apoio CNPq Proc. 553351/2005-2 "Metagenoma de Microrganismos de Ambientes Naturais da Amazônia". A diversidade funcional do processo de transformação de naftaleno que será avaliada através do sequenciamento de clones contendo o gene nahAc. Desta maneira, poderemos avaliar se as seqüências obtidas em solo TPI se assemelham àquelas encontradas nos demais ambientes estudados. Esse mesmo gene será usado para a quantificação por qPCR (PCR em tempo real ou PCR-quantitativo), para assim avaliarmos se a relação entre o número de cópias desse gene provenientes de Bacteria é a mesma encontrada em solos de clim. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador / Spartaco Astolfi-Filho - Integrante / Newton Paulo da Silva Falcão - Integrante / Wenceslau G. Teixeira - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1A. |
| 1. | 2004-2010. Silício e sua contribuição para o desenvolvimento vegetal e aumento de resistência a doenças em soja, feijoeiro e café Descrição: Os estudos realizados com o Si evidenciam a sua importância na ativação de genes que promovem a produção de enzimas relacionadas com os mecanismos de defesa da planta. Além disso, vários trabalhos demonstram incrementos significativos da taxa fotossintética, melhoria da arquitetura foliar e de outros processos no metabolismo vegetal, tendo como resultado final um aumento e maior qualidade na produção. Portanto, o Si tem alto potencial para ser utilizado extensivamente na agricultura, tanto convencional como orgânica. Este projeto propõe estudar a resistência sistêmica induzida em três culturas através silício, quando em presença de fungos patogênicos. Os estudos serão realizados em condições controladas, sendo avaliados três modelos de interação planta-fungo patogênico: a) soja - Diaporthe phaseorum f. meridionalis (cancro da haste); b) feijoeiro - Sclerotinia sclerotiorum (mofo branco) e c) café pelo fungo Hemileia vastatrix (ferrugem).. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Doutorado: (2) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Membro: Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1A. |
| 1. | 2000-2006. AEG - Agricultural and Environmental Genomes Descrição: Sequenciamento de Genomas Bacterianos e de Plantas (ESTs). Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador / Marília Caixeta Franco - Integrante / Flávia Theresa Hansem Pacheco - Integrante / José Elias Gomes - Integrante / Augusto Etchegaray Júnior - Integrante / Maria Estela Silva-Stenico - Integrante / David H. Moon - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1A. |
Data de processamento: 30/01/2023 10:53:53