Total de projetos de pesquisa



Número total de itens: 17

2016

1.   2016-Atual. EMU concedido no processo 2015/22617-5: Dual-laser Trace Gas Monitor
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Tsai Siu Mui.
2.   2016-Atual. INCT-Microbiomas
Descrição: INCT 2014. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Tsai Siu Mui - Integrante / Siu Mui Tsai - Coordenador / Daniel Saito - Integrante / Luiz Fernando Wurdig Roesch - Integrante.
Membro: Tsai Siu Mui.
3.   2016-Atual. Proposta de melhorias na infraestrutura de pesquisa do CENA: rede sem fio (wireless) e internet, central analítica multiusuário e destinação de resíduos químicos
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Tsai Siu Mui - Integrante / Siu Mui Tsai - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Tsai Siu Mui.
4.   2016-Atual. Reserva Técnica FAPESP para Apoio Institucional à Pesquisa
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Tsai Siu Mui - Integrante / Siu Mui Tsai - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Tsai Siu Mui.

2014

1.   2014-Atual. Dimensoes US-FAPESP Biota-SP: Pesquisa Colaborativa Integrando as dimensoes da Biodiversidade Microbiana ao Longo de Areas sob Alteracao do Uso da Terra em Florestas Tropicais (FAPESP-BIOTA-NSF DIMENSIONS)
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Doutorado: (8) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Integrante / Siu Mui Tsai - Coordenador / Jorge Mazza Rodrigues - Integrante / Brendan J. Bohannan - Integrante / Fernando Dini Andreote - Integrante / Paulo Artaxo - Integrante / Plinio Camargo - Integrante / Scott Saleska - Integrante / Carlos Martinez - Integrante. Financiador(es): National Science Foundation - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Tsai Siu Mui.

2011

1.   2011-2013. The microbiome of Amazonian Dark Earth: Structure and function of the microbial communities from rhizosphere and biochar associated to the biogeochemical processes (BIOTA/FAPESP: MICROORGANISMOS)
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (5) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador / Eikio Eurya Kuramae - Integrante / Aleksander Westphal Muniz - Integrante / Newton Paulo Falcão - Integrante / Carles R. Clement - Integrante / Eduardo Goes Neves - Integrante / Joao Lucio de Azevedo - Integrante / Fabiana de Souza Cannavan - Integrante / Mariana Germano Silva - Integrante / Rodrigo Gouvea Taketani - Integrante / Amanda Barbosa Lima - Integrante / Janne Louize Souza Santos - Integrante / Beata Emoke Madari - Integrante.
Membro: Tsai Siu Mui.

2010

1.   2010-2012. Aquisição de sistema com plataforma para microdissecção por captura a laser aplicada em estudos de biologia celular e molecular
Descrição: Sistema de plataforma, para tecnologia de microdissecção por gravidade e movimentação de feixe de laser sobre amostras, para possibilitar estudos por dissecção e captura de células de um tecido ou rizosfera, e ao mesmo tempo, garantindo alto desempenho em termos de velocidade e precisão da microdissecção de amostras com diferentes espessuras. Esta tecnologia tem sido aplicada para obter células de plantas e mais recentemente para estudar as interações planta-microrganismo. Particularmente, as técnicas usadas em estudos nas interações planta-microrganismos, são de grande relevância para as pesquisas planta-patógeno e planta-microrganismos mutualísticos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador / Maria Helena de Souza Goldman - Integrante / Adriana P M Rodrigues - Integrante / Marcelo Carnier Dornelas - Integrante / Adriana Pinheiro Martinelli - Integrante / Sergio Line - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Tsai Siu Mui.

2009

1.   2009-2011. Avaliação de sistemas de uso do solo por meio de indicadores de sustentabilidade ambiental microbiológico e bioquímico em sistemas florestais e agroflorestais
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Tsai Siu Mui - Integrante / Maria de Lourdes de Oliveira - Integrante / Maria de Lourdes Pinheiro Ruivo - Coordenador / Dirse Kern - Integrante. Financiador(es): Fundação Amazônia Paraense de Amparo à Pesquisa - Auxílio financeiro.
Membro: Tsai Siu Mui.
2.   2009-2011. Identificação de genes do feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris) envolvidos na resistência a estresses bióticos (antracnose) e abióticos (seca)
Descrição: O presente projeto pretende identificar genes que controlam os mecanismos de defesa e adaptação do feijoeiro à falta de água e ao ataque de patógenos durante o seu desenvolvimento, e identificar e analisar genes análogos de resistência (RGAs) em bancos de dados de sequências expressas (ESTs) de feijoeiro. Para isto, duas bibliotecas subtrativas de cDNA serão construídas para identificar genes diferencialmente expressos em variedades de P. vulgaris contrastantes quanto à tolerância ao estresse hídrico (5000 sequências por biblioteca); duas bibliotecas para identificar genes diferencialmente expressos em plantas inoculadas com C. lindemuthianum e induzidas ou não com silício (5000 sequências por biblioteca); e serão gerados marcadores moleculares TRAP para resistência a antracnose a partir de sequências buscadas no banco de dados do feijão comum. Os resultados obtidos fornecerão bases moleculares para o entendimento do controle genético da resistência do feijoeiro comum a estresses bióticos e abióticos de grande importância para a cultura, e poderão levar à indicação de genes candidatos para uso como marcadores moleculares e na transformação genética, auxiliando os programas de melhoramento genético. A interação entre os laboratórios de Biologia Celular e Molecular do CENA/USP, do Laboratório de Genética Fisiológica (ESALQ/USP) e do Laboratório de Genética de Leguminosas (IAC/APTA) proporcionará o intercâmbio entre as pesquisas com as variedades propostas neste projeto, muitas delas com grande potencial para comercialização, uma vez que provém de programa melhoramento genético de feijoeiro realizado pelo IAC/APTA, Campinas - SP.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (2) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador / Luís Eduardo Aranha Camargo - Integrante / Carlos Alberto Labate - Integrante / Adriana P M Rodrigues - Integrante / Marcelo Carnier Dornelas - Integrante / Sérgio Augusto Moraes Carbonell - Integrante / Danielle G.G. Caldas - Integrante / João Bosco dos Santos - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Tsai Siu Mui.
3.   2009-2013. Monitoring the microbial diversity and functional activities in response to land-use changes and deforestation under soybean and sugarcane cultivations
Descrição: A presente proposta deverá desenvolver ferramentas bioquímicas e moleculares para avaliar os impactos que as emissões dos gases de efeito estufa/sequestro de C devido ao uso da terra para cultivos de soja e cana-de-açúcar em três áreas localizadas em regiões de grande expansão agrícola dessas culturas, que incluem Mato Grosso (MT e MS) e São Paulo. Nossa proposta é integrar pesquisas de diferentes áreas da agronomia, química do solo e microbiologia, biologia molecular, bioinformática e geoprocessamento, em um esforço para detectar, quantificar e correlacionar os processos microbiológicos envolvidos nos processos de transformação envolvidos nos ciclos biogeoquímicos do C e N em solos sob cultivo de soja e cana-de-açúcar, tanto em áreas sob cultivo convencional como sob manejo conservacionista (plantio direto e uso de palhada), sempre em comparação com solos naturais, sem cultivo agrícola (floresta). Esta proposta recebeu apoio da FAPESP, dentro do Programa de Pesquisas sobre Mudanças Climáticas Globais (PFPMCG) para seu desenvolvimento ao longo dos próximos quatro anos (FAPESP 08/58114-3) e conta com apoio de pesquisadores do CENA/USP, FCAV/UNESP, FOP/UNICAMP (Site: http://www.fapesp.br/materia/5189). Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (3) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador / Eliana Gertrudes Macedo Lemos - Integrante / Daniel Saito - Integrante / Lúcia Maria Carareto Alves - Integrante / Carlos Clemente Cerri - Integrante / Brigitte Josefine Feigl - Integrante / Danielle G.G. Caldas - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Tsai Siu Mui.
4.   2009-2012. Tecnologia para produção em larga escala por cultivo in vitro de bambu gigante (Dendrocalamus giganteus Munro) e de carvão pirogênico a partir de seus subprodutos para a agricultura sustentável
Descrição: Dendrocalamus giganteus Munro é uma planta perene que pertence à sub-família Bambusoideae da família Poacea, das gramíneas. É considerada a maior espécie de bambu, contribuindo para a produção de grande quantidade de biomassa vegetal que pode ser processada para desenvolver novos produtos para substituir a madeira. A sua micropropagação tem sido recomendada, uma vez que seus propágulos são mais limitados e sementes são raras devido ao seu longo ciclo de florescimento de 76 anos. Dessa forma, tomando em consideração as dificuldades da propagação convencional de bambu, a micropropagação in vitro de gemas axilares se constitue como uma boa alternativa para a multiplicação em larga escala de bambu gigante (Dendrocalamus giganteus Munro). Durante o processo de produção convencional de carvão, aproximadamente 35% do carbono é fixado na forma de carvão, 35% do carbono compõem os chamados gases condensáveis (extrato pirolenhoso), 5% sob forma de alcatrão, sendo o restante lançado à atmosfera na forma de gases não condensáveis (CO2, CO, CH4 etc). Existe hoje tecnologia adequada para recuperação de até 50% do carbono perdido na forma de gases condensáveis, sendo o produto condensado explorado comercialmente por pequenas empresas (Benites et al. 2005), além de ser uma excelente forma de seqüestro de carbono para a atmosfera, contribuindo para diminuir a emissão de gases de efeito estufa. O objetivo principal desta proposta é de estabelecer um sistema de produção em larga escala de bambu gigante (Dendrocalamus giganteus Munro) para seu uso como fonte de biomassa e de madeira para a indústria e utilizar os subprodutos para produção de carvão pirogênico parcialmente carbonizados para recuperação de solos degradados, tanto como condicionador do solo e seqüestro de carbono sob forma reativa, como veículo de nutrientes e de microrganismos que atuam como promotores de crescimento vegetal. Para tanto, propõe-se o cultivo in vitro de D. giganteus por meio de micropropagação in vitro, a. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador / Adriana P M Rodrigues - Integrante / Newton Paulo da Silva Falcão - Integrante / Danielle G.G. Caldas - Integrante / José Otávio Brito - Integrante / Etelvino Henrique Novotny - Integrante / Monica Lanzoni Rossi - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Membro: Tsai Siu Mui.

2008

1.   2008-2012. Construção de bibliotecas subtrativas de cDNA para identificar genes diferencialmente expressos em cultivares de feijão (Phaseolus vulgaris L.) tolerantes e suscetíveis ao estresse hídrico
Descrição: Programa Nacional de Pós-Doutorado. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador / Danielle G.G. Caldas - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
Membro: Tsai Siu Mui.
2.   2008-2011. Detecção de Archaea metanogênicas, seu papel funcional e sua contribuição na estrutura das comunidades microbianas na Terra Preta Antropogênica e adjacência
Descrição: Métodos moleculares podem ser aplicados em estudos de diversidade microbiana da Terra Preta Antropogênica da Amazônia, possibilitando a identificação independente de cultivo de número abrangente de espécies bacterianas, incluindo aquelas fastidiosas ou não passíveis de cultivo, as quais dificilmente seriam identificadas pelos métodos convencionais. Para um estudo mais completo, propõe-se também associar métodos convencionais de isolamento para confirmação de espécies conhecidas e identificação de novas espécies. A análise das comunidades microbianas por T-RFLP (Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism) e DGGE (Denaturing Gradient Gel Electrophoresis) pode indicar a diversidade microbiana dos solos e determinar . É um método muito sensível a mudanças na estrutura microbiana do solo, além de possuir alta capacidade de processamento disponível, permite analisar comparativamente muitas amostras sob o foco da funcionalidade sob diferentes sistemas de uso da terra, usando TPA como solo modelo. Em casa-de-vegetação, o bolsista (Nível I) deverá participar dos estudos com TPA em microcosmos para avaliar o papel das Archaea metanogênicas e das amonificantes após a introdução de uma leguminosa ou de uma gramínea. O estudo da rizosfera das plantas deverá indicar qual das plantas hospedeiras contribui melhor para a transformação do nitrogênio orgânico e correlacionar com grupos funcionais de ciclagem de nitrogênio. O cultivo e detecção de Archaea metanogênicas pelo outro bolsista (Nível II) no estudo do metano poderá indicar a ação dos microrganismos Archaea no ambiente rizosférico, que deverá ser correlacionado com a presença dos metanogênicos. A detecção de Archaea metanogênicas do solo será realizada pela técnica de PCR, usando o gene mcrA como marcador molecular, além de permitir a sua detecção quantitativa nos sítios da rizosfera e nos solos adjacentes.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Especialização: (1) Doutorado: (1) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador / Rodrigo Gouvêa Taketani - Integrante / Wenceslau G. Teixeira - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Tsai Siu Mui.

2006

1.   2006-2008. Atividade metabólica, diversidade bacteriana da Terra Preta de Índio da Amazônia Central e determinação de compostos naturais produzidos por actinobactérias
Descrição: A elaboração de uma prospecção da caracterização bioquímica e da diversidade microbiana dos solos TPI é de suma importância para o conhecimento da extensão da diversidade deste bioma tropical e para a sustentabilidade da agricultura. Este projeto propõe efetuar análise da diversidade microbiana de solos TPIs através de atividades bioquímicas associadas com a presença dos microrganismos, determinar a estrutura dessas comunidades através da técnica de t-RFLP (Terminal Restriction Length Polymorphism) e desenvolver estudos com actinobactérias isoladas da Amazônia para identificação de peptídeos de origem não-ribossomal, que podem ser detectados intra ou extracelularmente em condições in vitro ou in vivo. As actinobactérias são consideradas as maiores produtoras de metabólitos secundários bioativos, tais como os antibióticos ou citostáticos. Devido à resistência a muito dos antibióticos pelas bactérias patogênicas, torna-se necessária a busca por novos produtos naturais, os quais são requeridos para o desenvolvimento de novos compostos farmacêuticos. Quimioensaios serão realizados para a busca de possíveis novos peptídeos. A extração e purificação serão realizadas por cromatografia líquida. Os peptídeos serão investigados quanto a sua capacidade quelante. Entre as enzimas envolvidas na biossíntese de metabólitos secundários encontram-se as sintases de policetônicos (PKSs) e as sintetases de peptídeos não-ribossômicos (NRPSs), cujas seqüências gênicas são conhecidas. A identificação das espécies que apresentam essas enzimas permitirá futuramente isolar o composto produzido e permitirá sua caracterização estrutural.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador / Brendan O´Neill - Integrante / Wenceslau G. Teixeira - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Tsai Siu Mui.
2.   2006-2009. Bioprospecção de genes associados à catálise e degradação enzimática de hidrocarbonetos policíclicos aromáticos por bactérias e por análise metagenômica em Terra Preta de Índio da Amazônia
Descrição: A caracterização de genes envolvidos na síntese de enzimas degradadoras de poluentes e xenobióticos, juntamente com estudos sobre a diversidade genética destas estirpes, poderão disponibilizar informações importantes sobre o comportamento destes microrganismos em condições ambientais extremas, bem como prover informação sobre a síntese de genes envolvidos em vias degradadoras para estudos de bioprospecção gênica, visando a busca por novas atividades catalíticas para fins químicos e biotecnológicos, refletindo o ilimitado poder da bioquímica microbiana em solos tropicais. Propõe-se em uma primeira etapa, a avaliação de isolados (em torno de 100) de Pseudomonas e Burkholderia provenientes de solos TPI e adjacência quanto à presença do gene nahAc e, através de bioensaios usando estirpes referências, determinar o seu potencial de degradação in vitro. Em paralelo, estudos sobre a biodiversidade genética desses isolados serão desenvolvidos através da técnica de Automated Ribossomal Intergenic Spacer Analysis (ARISA) para determinação das relações filogenéticas entre esses isolados e para estudos bioquímicos posteriores. Em uma segunda etapa, será prospectado o operon nahAc na já construída biblioteca metagenômica de solo TPI, sob coordenação do Prof. Spartaco Astolfi-Filho, da Universidade Federal do Amazonas (UFAM-Manaus, AM) e em colaboração com o CENA-USP, Piracicaba (SP), apoio CNPq Proc. 553351/2005-2 "Metagenoma de Microrganismos de Ambientes Naturais da Amazônia". A diversidade funcional do processo de transformação de naftaleno que será avaliada através do sequenciamento de clones contendo o gene nahAc. Desta maneira, poderemos avaliar se as seqüências obtidas em solo TPI se assemelham àquelas encontradas nos demais ambientes estudados. Esse mesmo gene será usado para a quantificação por qPCR (PCR em tempo real ou PCR-quantitativo), para assim avaliarmos se a relação entre o número de cópias desse gene provenientes de Bacteria é a mesma encontrada em solos de clim. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador / Spartaco Astolfi-Filho - Integrante / Newton Paulo da Silva Falcão - Integrante / Wenceslau G. Teixeira - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Tsai Siu Mui.

2004

1.   2004-2010. Silício e sua contribuição para o desenvolvimento vegetal e aumento de resistência a doenças em soja, feijoeiro e café
Descrição: Os estudos realizados com o Si evidenciam a sua importância na ativação de genes que promovem a produção de enzimas relacionadas com os mecanismos de defesa da planta. Além disso, vários trabalhos demonstram incrementos significativos da taxa fotossintética, melhoria da arquitetura foliar e de outros processos no metabolismo vegetal, tendo como resultado final um aumento e maior qualidade na produção. Portanto, o Si tem alto potencial para ser utilizado extensivamente na agricultura, tanto convencional como orgânica. Este projeto propõe estudar a resistência sistêmica induzida em três culturas através silício, quando em presença de fungos patogênicos. Os estudos serão realizados em condições controladas, sendo avaliados três modelos de interação planta-fungo patogênico: a) soja - Diaporthe phaseorum f. meridionalis (cancro da haste); b) feijoeiro - Sclerotinia sclerotiorum (mofo branco) e c) café pelo fungo Hemileia vastatrix (ferrugem).. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Doutorado: (2) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Tsai Siu Mui.

2000

1.   2000-2006. AEG - Agricultural and Environmental Genomes
Descrição: Sequenciamento de Genomas Bacterianos e de Plantas (ESTs). Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) . Integrantes: Tsai Siu Mui - Coordenador / Marília Caixeta Franco - Integrante / Flávia Theresa Hansem Pacheco - Integrante / José Elias Gomes - Integrante / Augusto Etchegaray Júnior - Integrante / Maria Estela Silva-Stenico - Integrante / David H. Moon - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Membro: Tsai Siu Mui.


Data de processamento: 06/11/2017 11:09:22